Zur Startseite von DrArbeit.de,
der deutschlandweiten Stellenbörse für Diplomarbeiten und Doktorarbeiten


Lupe2

Archiv - Stellenangebot

 

Dies ist ein Angebot aus der Datenbank von DrArbeit.de

Um die Datenbank komfortabel nach weiteren Angeboten durchsuchen zu können, klicken Sie einfach oben oder hier.

 
Archiv-Übersicht     Angebot Nr. 13632

Angebotsdatum: 1. Oktober 2019
Art der Stelle: Doktorarbeit
Fachgebiet: Informatik > Bioinformatik
Titel des Themas: Computersimulation 3-D-Genomarchitektur

Institut: Institute for Applied Computer Science
Adresse:
Prof. Gero Wedemann
Zur Schwedenschanze 15
18435 Stralsund
Tel.: +49-3831-45-7051   Fax.:
Bundesland: Mecklenburg-Vorpommern
Homepage: http://https://www.hochschule-stralsund.de/host/aktuelles/stellenangebote
E-Mail Kontakt: mail

Beschreibung: Im DFG-Schwerpunktprogramm "3-D-Genomarchitektur in Entwicklung und Krankheit" wird das Projekt "Von Fasern zum See von Nukleosomen: Computer-Simulationen der Regulation der räumlichen Struktur von Mbp Chromatin-Domänen im Zellkern" durchgeführt. Dabei wird die Faltung der DNA im Zellkern mit Hilfe von Computer-Simulationen in enger Zusammenarbeit mit verschiedenen experimentellen Arbeitsgruppen untersucht.

In diesem Projekt wird ein/e Doktorand/in Informatik, Physik oder benachbarte Fachgebiete E13 75% zum nächstmöglichen Zeitpunkt gesucht.

Die Tätigkeit umfasst die Weiterentwicklung des existierenden Computermodells und die Anwendung auf Massiv-parallelen Computern. Kenntnisse in Programmierung und Interesse für biologische Fragestellungen sind wichtig. Die notwendigen Kenntnisse in C++, MPI und OpenMP sowie Biologie und Monte Carlo-Algorithmen können bei der Arbeit erworben werden.

Informationen zur Arbeitsgruppe gibt es unter http://bioinformatics.hochschule-stralsund.de/

Die komplette Stellenanzeige findet sich unter https://www.hochschule-stralsund.de/host/aktuelles/stellenangebote/.

Die Hochschule Stralsund ist eine junge, sehr gut ausgestattete Hochschule, die direkt am Wasser liegt. Stralsund liegt vielleicht etwas abseits, bietet aber hervorragende Lebensbedingungen und Freizeitmöglichkeiten.
Methoden: Computer Simulationen
Monte Carlo
Replica Exchange
Simulated Annealing
Anfangsdatum: 1. November 2019
Geschätzte Dauer: 3 Jahre
Bezahlung: TVL E13 75%
Papers: Oliver Müller, Nick Kepper, Robert Schöpflin, Ramona Ettig, Karsten Rippe, Gero Wedemann: Changing chromatin fiber conformation by nucleosome repositioning. Biophysical Journal, 107 (9), 2141-2150, 2014.

René Stehr, Nick Kepper, Karsten Rippe, Gero Wedemann. The effect of the internucleosomal interaction on the folding of the chromatin fiber. Biophys. J., 95(8), 3677-3691, 2008.
Sonstiges:

Archiv-Übersicht