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Archiv-Übersicht     Angebot Nr. 14319

Angebotsdatum: 13. Juli 2021
Art der Stelle: Doktorarbeit
Fachgebiet: Physik > Biophysik
Titel des Themas: Super-resolution RNA Imaging

Institut: Angewandte Physik
Adresse:
Dr. rer. nat. Karin Nienhaus
Wolfgang-Gaede-Str. 1
76131 Karlsruhe
Tel.:    Fax.:
Bundesland: Baden-Württemberg
Homepage: http://www.aph.kit.edu/nienhaus/
E-Mail Kontakt: mail

Beschreibung: Genetically encodable fluorescence markers for imaging of specific RNA molecules in live cells are still very limited. Within the project ‘Super-resolution RNA Imaging with Aptamer-PAINT’, funded by the Baden-Württemberg Stiftung (collaboration with the Jäschke lab, IPMB, U Heidelberg), we develop advanced light-up RNA aptamers for live-cell super-resolution localization microscopy applications.
Methoden: advanced fluorescence microscopy (single-molecule localization microscopy,STED)
Opticsl spectroscopy (Uv/vis, fluorescence)
For data analysis: matlab, C++, Fiji
Anfangsdatum: 13. Juli 2021
Geschätzte Dauer: 3 Jahre
Bezahlung: TVL E13 75%
Papers: Wirth, R.; Gao, P., Nienhaus, G. U., Sunbul, M. and A. Jäschke. SiRA: A Silicon Rhodamine-Binding Aptamer for Live-Cell Super-Resolution RNA Imaging. J. Am. Chem. Soc. 141, 7562 (2019)

Sunbul, M., Lackner, J., Martin, A., Englert, D., Hacene, B., Grün, F., Nienhaus, K., Nienhaus, G. U., & A. Jäschke. Super-resolution RNA imaging using a rhodamine-binding aptamer with fast exchange kinetics. Nature Biotechnol.2021
Sonstiges: We are looking for an excellent, highly motivated person with a degree in (bio)physics, physical chemistry or related fields who is interested in working in an interdisciplinary team and who is strongly committed to careful biophysical experimentation (single molecule imaging) and computer-based quantitative data acquisition and analysis.

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