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Archiv-Übersicht     Angebot Nr. 14354

Angebotsdatum: 23. August 2021
Art der Stelle: Doktorarbeit
Fachgebiet: Chemie > Biochemie
Titel des Themas: Peptidbasiertes Fragmentscreening (Biochemie, Kristallographie, Peptidsynthese und rechnergestützte Methoden)

Institut: Institut für Bioanalytische Chemie
Adresse:
Prof. Norbert Sträter
Deutscher Platz 5
04103 Leipzig
Tel.:    Fax.:
Bundesland: Sachsen
Homepage: http://www.chemie.uni-leipzig.de/institut-fuer-bioanalytische-chemie.html
E-Mail Kontakt: mail

Beschreibung: In diesem Projekt wird kristallographisches Fragmentscreening zur Wirkstoffentwicklung eingesetzt. Die Zielproteine sind vor allem virale Proteasen wie die SARS-Cov2-Hauptprotease. Das Projekt beinhaltet Entwicklung von Methoden, die für die Ligandenfindung von peptidbindenden Proteintargets insgesamt von großem Interesse ist.

Es handelt sich um ein Verbundprojekt zwischen drei Arbeitsgruppen (Sträter, Hoffmann, Meiler), wobei die drei Doktoranden/innen eng zusammenarbeiten und die unter Methoden angeführten Arbeiten durchführen.

https://www.bbz.uni-leipzig.de/newsdetail/artikel/volkswagenstiftung-foerdert-erforschung-antiviraler-therapeutika-gegen-sars-cov-2-2021-06-30/
Methoden: (1) Kristallographische und biochemische Arbeiten
Präparation und Kristallisation der Targetproteine
Kristallographische Strukturanalysen im Hochdurchsatz

(2) Synthetische Arbeiten
Derivatisierung von Aminosäuren
Peptidsynthese

(3) Rechnergestützte Methoden
Docking von Fragmentbibliotheken (RosettaLigand und andere)
Fragmententwicklung: Growing, Linking, Merging

Alle drei Doktoranden/innen sind in die Auswertung und Weiterentwicklung der Fragmenthits zu affineren Inhibitoren involviert.
Anfangsdatum: 23. August 2021
Geschätzte Dauer: 3 Jahre
Bezahlung: Doktorandenstelle nach TVL
Papers:
Sonstiges:

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